Martin Frutiger gewann die ersten Preise des internationalen Oboenwettbewerbes der Händelfestspiele in Halle an der Saale und des «Concours National d‘Execution Musicale» in Riddes. Im Oktober 2003 wurde Martin Frutiger am internationalen Oboenwettbewerb in Tokio mit dem zweiten Preis ausgezeichnet. Im gleichen Jahr war er auch Finalist des «New Talent»-Wettbewerbs der europäischen Rundfunkstationen (EBU).
Als Solist trat er unter anderem mit den Berner und Luzerner Sinfonieorchestern, dem Slowakischen Radiosinfonieorchester, dem Tokyo Philharmonic Orchestra, dem Münchener Kammerorchester, dem Kammerorchester Basel, der Philharmonie in Sibiu (Rumänien), der Capella Istropolitana und dem Neuen Bachischen Collegium Musicum Leipzig auf. Im Januar 2007 war er Solist in Stanislaw Skrowaczewskis Englischhornkonzert mit dem Tonhalle-Orchester Zürich unter der Leitung des Komponisten.
Im englischen Label «guild» sind drei CDs mit romantischen Werken für Englischhorn und Klavier erschienen. Martin Frutiger ist künstlerischer Leiter für Oboe von «The Muri Competition».